Raychaudhuri 연구실 수련회 2023 (매사추세츠주 하버 아일랜드)'레이추두리 연구실'은 면역 매개 질환의 유전학과 유전체학에 대해 연구하고 있습니다. 우리 연구소는 류마티스 관절염, 제1형 당뇨병, 결핵과 같은 질병의 기저 분자 메커니즘을 이해하기 위해 대규모 인간 유전학, 단세포 전사체학, 계산 모델링을 다루고 있습니다.
1. 호스트 연구원(PI) 및 연구실 개요
■ 기관/소속부서
브리검 여성병원 유전학과
하버드 의과대학
■ 연구실 이름
레이추두리 연구실
■ 연구책임자(PI) 정보
Soumya Raychaudhuri, MD, PhD
Walbert 하버드 의과대학 교수 및 생물의학 정보학 교수
브리검 여성병원 데이터 과학 센터 소장
MIT 및 Harvard Broad Institute 연구원
75 Francis Street, Boston, MA 02115soumya@broadinstitute.org
연구실 웹사이트 또는 관련 링크: https://immunogenomics.bwh.harvard.edu
2. 연구분야 및 전문성
■ 핵심 연구분야
면역유전학, 인간유전학, 자가면역질환, 단세포유전체학, 전산생물학
■ 연구목표 및 비전
Raychaudhuri 연구소는 면역 매개 질환의 유전학과 유전체학을 조사합니다. 이 연구실에서는 대규모 인간 유전학, 단일 세포 전사체학 및 전산 모델링을 통합하여 류마티스 관절염, 제1형 당뇨병 및 결핵과 같은 질병의 근본적인 분자 메커니즘을 이해합니다. 우리의 목표는 다음과 같습니다. • 자가면역 질환 위험을 유발하는 유전 변이의 미세 매핑. • 단일 세포 다중 오믹스를 통해 면역 세포 상태 및 기능 특성화. • 염색질 및 유전자 발현 데이터를 통합하여 상황별 유전적 효과를 이해합니다.
■ 프로그램 관련 연구 분야
면역유전학, 단세포 전사체학, 자가면역질환 유전학
■ 주요실적/대표저서(최근 3~5년간)
• Baglaenko, Y., Mu, Z., Curtis, M. et al. Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells. Nature 2025. https://doi.org/10.1038/s41586-025-09313-3
• Kotliar D, Curtis M, Agnew R, Weinand K, Nathan A, Baglaenko Y, Zhao Y, Sabeti PC, Rao DA, Raychaudhuri S. Reproducible single cell annotation of programs underlying T-cell subsets, activation states, and functions. bioRxiv [Preprint]. 2024 May 5:2024.05.03.592310. doi: 10.1101/2024.05.03.592310. PMID: 38746317; PMCID: PMC11092745.
• Rumker L, Sakaue S, Reshef Y, Kang JB, Alquicira-Hernandez J, Valencia C, Nathan A, Raychaudhuri S. Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data. Nature Genetics 2024;56(5):615–626. doi:10.1038/s41588-024-01909-7
• Zhang F, Jonsson AH, Nathan A, Wei K, Brenner MB, Rao DA, Donlin LT, Raychaudhuri S. Deconstruction of rheumatoid arthritis synovium defines inflammatory subtypes. Nature 2023;623(7989):616–624. doi:10.1038/s41586-023-06708-y
• Sakaue S, Weinand K, Gupta A, Loh PR, Nathan A, Raychaudhuri S. Tissue-specific enhancer-gene maps from multimodal single-cell data identify causal disease alleles. Nature Genetics 2024;56(2):228–238. doi:10.1038/s41588-024-01682-1
3. 인프라 및 이용 가능한 기술/장비
■ 연구실에서 사용할 수 있는 주요 기술, 도구 또는 플랫폼에 대한 설명
Raychaudhuri 연구소는 컴퓨팅 리소스와 단일 세포 시퀀싱 플랫폼에 대한 공동 액세스를 갖추고 있습니다.• 높은 처리량 시퀀싱 및 단일 세포 RNA-seq 플랫폼• 유전자 미세 매핑 및 통합 분석을 위한 생물정보학 파이프라인• Broad Institute 리소스 및 Brigham Genomics 핵심 시설에 대한 액세스
■ Mentoring
Raychaudhuri 박사는 의학, 유전학, 컴퓨터 생물학 분야의 수련생들을 멘토링했습니다. 그의 멘티는 계속해서 연구 그룹을 이끌고, 학문적 경력을 계속하고, 업계 환경에서 일했습니다. 훈련생들은 영향력이 큰 출판물과 AMP RA/SLE와 같은 주요 국제 협력에 적극적으로 기여합니다.