1. 호스트 연구원(PI) 및 연구실 개요
■ 기관/소속부서
채닝 네트워크 의학부
브리검 여성병원하버드 의과대학
■ 연구책임자(PI) 정보
윤정현, MD, MPH
의학과 조교수,
하버드 의과대학 원장,
채닝 네트워크 의학부 기능 유전체학 연구실
221 Longwood Ave, 보스턴, MA 02115
Email: jhyun@bwh.harvard.edu
연구실 홈페이지 또는 관련 링크https://cdnm.bwh.harvard.edu/ Jeong-h-yun-md-mph/
2. 연구분야 및 전문성
■ 핵심 연구분야
만성폐질환, 단세포전사체학, 공간오믹스, 면역학, 중개의학
■ 연구목표 및 비전
Yun Lab은 대규모 코호트 기반 인간 데이터와 유전체학 도구를 결합하여 실험실 기반 검증을 안내함으로써 만성 폐쇄성 폐질환(COPD)에 대한 면역학적 하위 유형과 치료 표적을 식별하는 데 중점을 두고 있습니다. 윤 박사의 업무에는 호산구성 COPD의 악화 위험을 예측하기 위한 혈액 호산구 역치 및 분자 특징을 정의하는 일이 포함되어 있으며, 호산구성 COPD에 대한 생물학적 치료법의 성공적인 임상 시험에 기여하고 있습니다. 그녀는 또한 쥐 모델에서 COPD GWAS 유전자 HHIP와 관련된 특정 T 세포 집단을 확인했으며, 이는 단일 세포 연구를 통해 인간 COPD에서 확인되었습니다. 최근 그녀의 연구는 클론으로 확장된 면역 세포와 폐 세포의 체세포 돌연변이가 어떻게 만성 폐 질환에 기여하는지 조사하는 것으로 확대되었습니다.
■ 프로그램 관련 연구 분야
중개연구, 오믹스, 기능유전체학
■ 주요실적/대표저서
- Yun JH*, Khan MAW*, Ghosh A, Hobbs BD, Castaldi PJ, Hersh CP, Miller PG, Cool CD, Sciurba F, Barwick L, Limper AH, Flaherty K, Criner GJ, Brown K, Wise R, Martinez F, Silverman EK, DeMeo D, NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) Consortium; Cho MH, Bick AG. Clonal somatic mutations in chronic lung diseases are associated with reduced lung function. Am J Respir Crit Care Med. 2023 Dec 1:208(11):1196-1205. PMID37788444
- Villasenor-Altamirano AB, Jain D, Jeong Y, Menon JA, Kamiya M, Haider H, Manandhar R, Sheikh MDA, Athar H, Merriam LT, Ryu MH, Sasaki T, Castaldi PJ, Rao DA, Sholl LM, Vivero M, Hersh CP, Zhou X, Veerkamp J†, Yun JH†, Kim EY†; MassGeneralBrigham-Bayer Pulmonary Drug Discovery Laboratory. Activation of CD8+T cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Lung. Am J Respir Crit Care Med. 2023 Dec 1:208(11):1177-1195. PMID 37756440
- Si Y, Lee CH, Hwang Y, Yun JH, Cheng W, Cho C, Quiros M, Nusrat A, Zhang W, Jun G, Zollner S, Lee JH, Kang HM. FICTURE: scalable segmentation-free analysis of submicron resolution spatial transcriptomics. Nat Methods 2024 Sep12 doi: 10.1038/s41592-024-02415-2. Online ahead of print. PMID 39266749
- Yun JH, Lee S, Srinivasa P, Morrow J, Chase RP, Saferali A, Xu Z, Cho MH, Castaldi PJ, Hersh CP. An interferon inducible signature of airway disease from blood gene expression profiling. Eur Respir J. 2021 Oct 14;2100569. PMID 34649980.
- Yun JH*, Lee C*, Liu T, Liu S, Kim EY, Xu S, Curtis JL, Pinello L, Bowler RP, Silverman EK, Hersh CP, Zhou X†. Hedgehog interacting protein-expressing lung fibroblasts suppress lymphocytic inflammation in mice. JCI Insight. 2021 Sep 8;6(17):e144575. PMID: 34375314; PMC8492352
3. 인프라 및 이용 가능한 기술/장비
■ 연구실에서 사용할 수 있는 주요 기술, 도구 또는 플랫폼에 대한 설명
BWH의 의학부, 전용 컴퓨터 클러스터 및 생물정보학 인프라를 갖춘 최대 연구 부서
TOPMed 컨소시엄을 통해 대규모 코호트 수준의 오믹스 및 표현형 데이터에 대한 액세스 및 협업
생물정보학 분석부터 기능 검증까지 포괄하는 프로젝트
핵심 기술에는 단일 세포 전사체학, 조직학 분석, 공간 전사체학, 게놈 데이터 분석 및 면역학적 표현형 분석이 포함됩니다.
■ Mentoring
윤 박사는 학생, 의사-과학자, 박사후 연구원을 멘토링하는 데 최선을 다하고 있습니다. 그녀는 연수생이 독립적인 연구 경력을 쌓을 수 있도록 준비시키는 것을 목표로 생물정보학 분석, 폐 병리생물학 및 임상 의학을 연결하는 지원적이고 엄격한 환경을 조성합니다. 멘티는 실험실 기술자 및 과학자, 유전학자 및 유전 역학자, 생물통계학자, 전산 생물학자, 중개 과학자 및 임상의로 구성된 학제간 팀과 협력하게 됩니다.